担当者に見せたくないメニューを、管理者が隠せますか？

できます。ユーザー登録のサイト権限設定にあるクイックメニュー表示設定で、ユーザーごと・サイトごとに、クイックメニューに表示するリンクを絞れます。制限を「あり」にして、表示するリンクにチェックを付けます。制限は隠す方向にだけ働き、もともと権限の無いリンクを表示することはできません。設定はユーザーのCSV入出力でも出し入れできます。